Мало кто слышал о Филиппе до его перехода в Ливерпуль. Дважды он выходил победителем из гонки за титул чемпиона Швейцарии с Базелем. После этого, в 2005, Деген стал игроком Дортмундской Боруссии. Первый сезон он провел довольно неплохо, однако травмы приходили одна за другой, и в сезоне 2007-08 он провел только 10 матчей. Контракт швейцарца с немцами истек, и он, получив статус свободного агента, перешел в Ливерпуль.

Бенитес был безмерно счастлив, подписав его: "Он великолепен в атаке, у него менталитет победителя. Проходы по флангу - его сильные стороны, и я уверен, что он будет великолепным дополнением к нашей команде. Когда ты видишь, что есть возможность заполучить такого футбольного гения бесплатно - нужно действовать не задумываясь, ведь созхраненные деньги можно потратить на усиление других позиций. Он нам, безусловно поможет".

Но Рафа ошибался. Глубоко ошибался. Травмы продолжили преследовать Филиппа. О нем поговаривали, что он и шагу ступить не может, не получив травму. Дебютировал он, однако, неплохо, выйдя в стартовом составе на матч против Крю. Но уже во втором матче, против Тоттенхема, он таки получил свою первую травму. В сезоне 2009-10 он фигурировал, к удивлению многих, в 11 матчах из 56. Сейчас ему исполнилось 27 лет, он так и не завоевал места даже под основой. Кроме того, Стивен Дарби вернулся из аренды, а Глен Джонсон пообещал постоянно быть в форме. У него осталось два года по контракту. Первый из них Филипп проведет в немецком Штутгарте, куда он был отдан в аренду с правом последующего выкупа.

Летом 2011 Ливерпуль разорвал контракт с защитником, и несколько месяцев швейцарец слыл без клуба. Но в середине октября он начал тренироватся со своим бывшим клубом - Базелем, а в ноябре того же года стал его полноправным игроком.