Кенни Далглиш заприметил молодого форварда во время его выступления в матче за Карлайл против Ливерпуля в рамках юношеского Кубка Англии. Итак, проведя всего 13 матчей за основу Карлайла, Стив отправляется в Ливерпуль. Вскоре Харкнесс перепрофилировался в полузащитники, и казалось, что его ждёт великое будущее в Мерсисайде, так как к тому времени он стал капитаном сборной Англии U-18. Однако, молодого футболиста постигают две тяжелейшие травмы, которые отправляют его в резерв клуба, где он начал выступать в новом для себя амплуа - левого защитника. И при Далглише, и при Сунессе Стив безуспешно сражался за место в основе клуба. Когда на пост тренера пришёл Эванс, неоднократно поднимался вопрос о продаже Харкнесса, но всё же он получил шанс заиграть в Ливерпуле. В первой половине сезона 1995-96 Стив в схеме Эванса 3-5-2 занял позицию левого крайнего защитника. 

Весьма вспыльчивый защитник часто зарабатывал предупреждения, что и стоило ему места в старте команды. Возвращение футболиста в основу произошло 6 апреля 1996 года в игре с Ковентри, однако после часа встречи он получил перелом ноги, который на 11 месяцев оставил его без футбола. Сезон 1997-98 Стив постоянно выходил на поле, но с назначением Улье его фамилия стала одной из первых в списке футболистов, с которыми клуб расстался. Харкнесс отправился в португальскую Бенфику, которой заправлял старый знакомый Грэм Сунесс. С ним же он вернулся на родину, где они устроились в Блэкберн Роверс.