Джо играл на позиции центрального форварда и провел несколько сезонов в составе "Красных" в первой декаде XX века. Начинал он карьеру левым инсайдом в Сандерленде, а в сезоне 1903-04 переехал в Мерсисайд. Там он моментально завоевал место в основном составе, сыграв в 10 последних матчах, однако не смог спасти Ливерпуль от вылета. Во втором дивизионе, когда команда вернулась в элиту, Джо провел лишь девять игр. В следующем сезоне он вернулся в обойму, став лучшим бомбардиром команды с 24 голами в 37 матчах.

Травмы и другие недуги не позволили Хьюитту оставаться на вершине, кроме того, в центре место в осонове за собой застолбил легендарный Сэм Рэйбоулд. После того, как Рэйбоулд покинул Ливерпуль, Джо вернулся к забиванию голов. 33 раза он поражал ворота соперников в 69 играх в период 1907-1909. В сезоне 1909-10 он добавил в свой актив четыре выхода на поле, после чего перешел в Болтон.

Проведя там год, Хьюитт завершил карьеру и на протяжении 60 лет был членом тренерского штаба Ливерпуля, а также стюардом клуба.